22/12/2013 | 3 | 3 | 1 | 3 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | H | Y | Y | 4 | 6 | 5 | 5 | C | C | 4 | 4 | 5 | 5 | 3 | 3 | 5 | 5 | 6 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 4 | 6 | 5 | 4 | 5 | 6 | 4 | 5 | 7 | 4 | 6 | 4 | 5 | 7 | 7 | 7 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 5 | 6 | 5 | 6 | 4 | 4 | 4 | A | 4 | 4 | B | 5 | 7 | 5 | 6 | 5 | 7 | 5 | 5 | 5 | 5 | 7 | 6 | 5 | 6 | 4 | 5 | 4 | 4 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||
k nordtvedt | 9 | 9 | 9 | 9 | 8 | 8 | 2 | 8 | 3 | 8 | 9 | 8 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 4 | 3 | 4 | 4 | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | 4 | C | C | 5 | 0 | 7 | 7 | D | D | 4 | 3 | 3 | 7 | 9 | 9 | 9 | 3 | 4 | 7 | 0 | 1 | 2 | 1 | 1 | 5 | 9 | 3 | 9 | 3 | 5 | 4 | 8 | 2 | 4 | 1 | 6 | 8 | 7 | 4 | 9 | 6 | 1 | 8 | 3 | 9 | 4 | 1 | 1 | 1 | 0 | 5 | 4 | 8 | 2 | 9 | 3 | 3 | 7 | 3 | 6 | 5 | 4 | 1 | 6 | 4 | 0 | 2 | 1 | 9 | 5 | 3 | 1 | 0 | 1 | 6 | 5 | 2 | 3 | 8 | 4 | 9 | 1 | 3 | 6 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||
3 | 0 | 1 | 5 | 5 | 6 | 8 | 9 | 9 | 2 | 9 | 8 | 9 | 9 | 5 | 4 | 7 | 7 | 8 | 9 | 4 | 4 | 4 | 4 | 0 | A | A | 6 | 7 | 6 | 0 | Y | Y | 2 | 8 | 1 | 8 | 5 | 5 | 0 | 7 | 1 | 2 | 6 | 1 | 5 | 3 | 3 | 7 | 4 | 6 | 0 | 4 | 0 | 4 | 1 | 0 | 6 | 7 | 8 | 7 | 2 | 0 | 2 | 5 | 0 | 5 | 2 | 5 | 0 | 4 | 6 | 7 | 5 | 6 | 9 | 9 | 2 | 4 | 3 | 6 | 5 | 8 | 2 | 2 | 5 | 0 | 3 | 1 | 7 | 5 | 2 | 3 | 0 | 2 | 5 | 4 | 3 | 1 | 2 | 6 | 5 | 7 | 3 | 7 | 0 | 4 | 1 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||
a | b | 1 | 2 | a | b | a | b | c | d | a | b | a | b | a | b | a | b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mut rate-> | 0.76 | 3.11 | 1.51 | 2.65 | 2.26 | 2.26 | 0.09 | 0.22 | 4.77 | 1.86 | 0.52 | 2.42 | 8.14 | 1.32 | 1.32 | 0.16 | 0.16 | 2.64 | 0.99 | 1.35 | 8.38 | 5.66 | 5.66 | 5.66 | 5.66 | 4.02 | 2.08 | 1.23 | 1.23 | 7.35 | 4.11 | 10.22 | 7.90 | 35.31 | 35.31 | 3.24 | 0.55 | 0.26 | 0.10 | 0.27 | 0.27 | 0.07 | 0.53 | 0.07 | 0.04 | 1.21 | 1.28 | 0.10 | 2.52 | 2.52 | 4.97 | 0.32 | 0.22 | 0.19 | 10.43 | 0.15 | 2.96 | 5.31 | 1.66 | 3.14 | 0.62 | 0.35 | 0.92 | 1.89 | 0.47 | 0.15 | 0.56 | 8.4 | 4.8 | 5.2 | 0.53 | 1.74 | 0.95 | 3.79 | 1.62 | 1.32 | 0.93 | 1.8 | 2.36 | 2.30 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
<--------> | This rose color means clade needs snp tag(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TMRCA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Basic I1* | 4500 bp | 13 | 22 | 14 | 10 | 13 | 14 | 11 | 14 | 11 | 12 | 11 | 28 | 15 | 8 | 9 | 8 | 11 | 23 | 16 | 20 | 28 | 12 | 14 | 15 | 16 | 10 | 10 | 19 | 21 | 14 | 14 | 12 | 10 | 11 | 8 | 15 | 15 | 8 | 11 | 10 | 8 | 9 | 9 | 12 | 23 | 25 | 15 | 10 | 12 | 12 | 8 | 13 | 25 | 20 | 13 | 13 | 11 | 12 | 11 | 11 | 12 | 11 | 12 | 8 | 17 | 12 | 24 | 27 | 19 | 11 | 12 | 12 | 13 | 11 | 9 | 11 | 11 | 10 | 12 | 12 | 31 | 11 | 13 | 21 | 16 | 11 | 10 | 15 | 11 | 24 | 17 | 13 | 15 | 25 | 12 | 21 22 | 18 | 12 | 14 | 18 | 9 | 12 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Clades | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1xL22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1 Z140+ L338+ | 1850 bp | 22 | 26 | 15 | 11 | 9 | 15 | 15 | 16 | 22 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1H | 400 bp | 13 | 12 | 27 | 22 | 26 | 15 | 11 | 9 | 15 | 15 | 17 | 22 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS11616 | 2100 bp | 22 | 27 | 15 | 11 | 9 | 16 | 16 | 16 | 26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS114 | 800 bp | 22 | 26 | 11 | 9 | 15 | 26 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS8 L338+ | 2000 bp | 22 | 26 | 16 | 17 | 11 | 9 | 15 | 15 | 10 | 22 | 14 | 13 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS889 | 14 | 15 | 8 | 22 | 29 | 14 | 15 | 13 | 8 | 12 | 14 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS814 Z140+ | 1700 bp | 22 | 14 15 | 15 | 8 | 22 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-Pan | 1650 bp | 10 | 29 | 22 | 14 | 15 | 13 | 22 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
F2642+ AS5 | 14 | 13 | 16 | 22 | 15 | 22 | 13 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS5a | 14 | 13 | 16 | 22 | 15 | 22 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS6 F2642+ | 14 | 22 | 14 | 14 | 15 | 15 | 22 | 13 | 26 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14/22 Complex | 2400 bp | 14 | 22 | 15 | 22 | 13 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1312 Z140+ | 13 | 27 | 16 | 22 | 15 | 12 | 14 | 12 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nor31 | 14 | 15 | 31 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS9/AS16 Z73+ L1302+ | 2200 bp | 15 16 | 16 | 29 | 15 | 11 | 15 | 19 | 12 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS9/AS16 L1302- | 15 16 | 16 | 29 | 15 | 11 | 20 | 20 | 12 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L803+ | 29 | 16 | 21 | 19 | 23 | 14 | 11 | 20 | 18 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L573+ | 900 bp | 23 | 15 | 15 | 11 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS3 Z382+ | 2900 bp | 14 | 24 | 30 | 15 | 16 | 13 | 25 | 15 | 25 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS3911 | 12 | 9 | 19 | 29 | 17 | 11 | 15 | 14 | 11 | 15 | 16 | 16 | 13/14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-Sw Z382+ | 13 | 29 | 14 | 22 | 19 | 30 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS13 Z2040+ | 15 | 29 | 14 | 21 | 29 | 13 | 18 | 30 | 16 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1015 Z59+ Z60- Z382- | 12 13 | 29 | 11 | 15 | 10 | 14 | 15 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1911 Z382+ | 800 bp | 11 | 13 | 15 | 29 | 24 | 19 | 29 | 15 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS2514 | 15 | 14 | 13 | 25 | 14 | 14 | 12 | 26 | 18 | 25 | 15 | 13 | 25 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS10a | 12 | 13 | 29 | 29 | 15 | 12 | 19 | 14 | 13 | 10 | 16 | 11 | 12 | 14 | 13 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS10b | 15 | 13 | 29 | 16 | 30 | 14 | 13 | 10 | 11 | 13 | 13 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS2 Z138+ Z2541- | 1600 bp | 14 | 16 | 29 | 11 | 15 | 11 | 13 | 14 | 13 | 15 | 25 | 22 | 20 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ESc13 Z2541+ | 2000 bp | 15 | 30 | 14 | 15 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1221 Z139+ | 12 | 21 | 15 | 29 | 11 | 27 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1010.2 Z138+ Z139+ | 15 | 10 | 12 | 14 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS10910 Z138+ Z2541- | 23 | 13 | 10 | 14 | 9 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1313 Z138+ | 29 | 11 | 13 | 13 | 10 | 17 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1414 | 15 | 12 | 29 | 11 | 15 | 13 14 | 14 | 12 | 12 | 32 | 12 | 26 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS917 | 14 | 9 | 29 | 17 | 11 | 9 | 13 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS112413 | 16 | 29 | 15 | 11 | 24 | 11 | 13 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS22 | 16 | 22 | 12 | 13 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-T2 Z63+ L1237+ | 3200 bp | 23 | 7 | 27 | 18 | 12 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-T2EB Z63+ | 23 | 7 | 22 | 12 | 8 | 27 | 12 | 11 | 18 | 12 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-T18 L1237+ | 7 | 18 | 23 | 14 | 27 | 21 | 12 | 16 | 12 | 14 | 17 | 12 | 23 | 12 | 16 | 26 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-T10 | 23 | 15 | 16 | 7 | 12 | 14 | 11 | 27 | 10 | 14 | 10 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-Iber Z63+ | 23 | 11 | 15 | 22 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS159 Z63+ L1237- | xxx | 15 | 23 | 14 | 13 | 16 | 29 | 17 | 13 | 25 | 25 | 9 | 26 | 11 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS122410 | 12 | 24 | 29 30 | 15 | 24 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS121230 | 12 | 14 | 12 | 16 | 24 | 30 | 15 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-Yk Z63+ | 1000 bp | 12 | 14 | 30 | 15 | 9 | 11 | 11 | 11 | 15 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ASrec9 | 14 | 13 | 29 | 9 | 9 | 14 | 14 | 16 | 16 | x | x | 14 | 9 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1511 | need snps | 15 | 15 | 13 | 29 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1512 | need snps | 13 14 | 29 | 15 | 16 | 17 | 27 | 12 | 10 | 12 | 11 | 32 | 23 | 15 | 17 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1111 | need snps | 11 | 14 | 14 | 29 | 15 | 15 | 11 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS161616 | 14 | 16 | 16 | 10 | 30 | 15 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1212 | 1900 bp | 12 | 14 | 12 | 12 | 16 | 20 | 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS121210 DF29- Z131- | 15 | 12 | 12 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1310 Z131+ | 16 | 13 | 10 | 16 | 16 | 10 | 8 | 18 | 19 | 19 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS2122 DF29* | 21 | 15 | 16 | 24 | 11 | 22 | 12 | 12 | 14 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mav11 DF29* | 23 | 14 | 14 15 | 16 | 10 | 11 | 23 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS12 DF29* | 14 | 13 | 29 30 | 16 17 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS4 DF29* | 1000 bp | 15 | 29 | 13 | 14 | 15 | 9 | 14 | 25 | 28 | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P1a DF29* | 1800 bp | 11 | 14 | 12 | 24 | 15 | 14 | 23 | 18 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P1b DF29* | 1800 bp | 11 | 14 | 12 | 24 | 14 | 23 | 18 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P2 DF29* | 2700 bp | 11 | 14 | 15 | 12 | 23 | 18 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ML DF29* | 1500 bp | 12 | 24 | 29 | 11 | 14 | 10 | 16 | 12 | 12 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS1114 DF29* | 2630 bp | 14 | 13 | 29 | 30 | 11 12 | 13 | 11 | 14 | 11 | 11 | 16 | 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS7E1 L1274+ | 475 bp | 14 | 15 | 12 | 9 | 15 | 20 | 23 | 11 | 13+ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AS7E2 L1275+ | 1450 bp | 14 | 15 | 12 | 9 | 22 | 24 25 | 12 | 13+ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1b M227 | 3000 bp | 14 | 21 | 6 copies | 13 | 26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1-SwF | 14 | 13 | 24 | 30 | 17 | 13 | 15 | 12 | 14 | 14 | 14 | 13 | 12 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Basic I1* | 4500 bp | 13 | 22 | 14 | 10 | 13 | 14 | 11 | 14 | 11 | 12 | 11 | 28 | 15 | 8 | 9 | 8 | 11 | 23 | 16 | 20 | 28 | 12 | 14 | 15 | 16 | 10 | 10 | 19 | 21 | 14 | 14 | 12 | 10 | 11 | 8 | 15 | 15 | 8 | 11 | 10 | 8 | 9 | 9 | 12 | 23 | 25 | 15 | 10 | 12 | 12 | 8 | 13 | 25 | 20 | 13 | 13 | 11 | 12 | 11 | 11 | 12 | 11 | 12 | 8 | 17 | 12 | 24 | 27 | 19 | 11 | 12 | 12 | 13 | 11 | 9 | 11 | 11 | 10 | 12 | 12 | 31 | 11 | 13 | 21 | 16 | 11 | 10 | 15 | 11 | 24 | 17 | 13 | 15 | 25 | 12 | 21 | 18 | 12 | 14 | 18 | 9 | 12 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
L205+ | 23 | 14 | 11 | 10 | 13 | 11 | 13 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1 L22+ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Basic I1d L22+ | 3100 bp | 23 | 14 | 10 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-13 | 23 | 14 | 15 | 13 | 24 | 19 | 15 | 16 | 10 | 13 | 15 | 17 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-911 | 14 | 23 | 11 | 14 | 15 16 | 9 | 10 | 24 | 14 | 13 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-911 (recLOH) | 14 | 23 | 14 | 9 | x | x | y | y | 9 | 21 | z | z | 10 | 24 | 13 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-913 | 23 | 9 | 14 | 29 | 29 | 13 | 10 | 14 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-1110 | 23 | 11 | 14 | 13 | 15 | 10 | 12 | 10 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-1315 | 15 | 16 | 14 | 10 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L22-241510 | 23 | 11 | 14 | 15 | 29 | 24 | 30 | 15 | 11 | 10 | 10 | 24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
I1d-Nun14 | 23 | 14 | 14 15 | 14 | 10 | 12 | 14 | 25 | 13 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nun1424 | 24 | 14 | 15 | 29 | 21 | 14 | 17 | 10 | 12 | 26 | 21 | 14 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NuN1419 | 23 | 15 | 14 | 15 | 29 | 19 | 29 | 14 | 10 | 24 | 14 | 14 | 14 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Basic P109+ | 3100 bp | 23 | 14 | 10 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-9 | 23 | 15 | 11 | 14 | 9 | 20 | 10 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-19 | 23 | 14 | 12 | 14 | 10 | 19 | 13 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-13 | 23 | 13 | 13 | 10 | 24 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-14 | 14 | 23 | 14 | 29 | 27 | 14 | 15 | 16 | 19 | 15 | 10 | 24 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-1313 | 23,24 | 14 | 13 | 21 | 15 | 15 | 13 | 10 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-1515 | 15 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
P109-Balkan (L/H) | 13 | 22 | 17 | 11 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
uN2 L813+ | 23 | 14 | 15 | 29 | 11 | 14 | 10 | 24 | 12 | 13 | 25 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
uN2-9 | 23 | 14 | 15 | 29 | 11 | 14 | 9 | 10 | 24 | 12 | 13 | 25 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
uN-9a | 23 | 14 | 14 15 | 12 | 13 | 29 | 27 | 14 | 15 | 9 | 10 | 24 | 13 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bothnian L287+ | 23 | 14 | 10 | 29 | 15 | 9 | 21 | 24 | 30 31 | 12 | 13 | 18 | 26 |